Naja, eine sehr unspezifische Frage. Deshalb zuerst mal der Verweis auf Google (insbesondere www.google.co.jp), wo Trefferzahlen angezeigt werden. Diese Zahlen sind zwar mit Vorsicht zu genießen, sind aber für eine grobe Einordnung hilfreich.
Ansonsten gibt es genug Listen dazu im Internet (Stichworte: "word frequency", "単語(の)頻度", "使用頻度" usw.).
Es gibt auch einige einsprachige Wörterbücher, die Häufigkeitsklassen markieren, z.B. im
三省堂国語辞典 als 社会常識語 oder im
新明解国語辞典.